Silviatun Nihayah, 4411412042 (2016) KEANEKARAGAMAN ALEL MIKROSATELIT DURIAN LOKAL KOLEKSI EX SITU HORTIMART BAWEN JAWA TENGAH. Under Graduates thesis, Universitas Negeri Semarang.

Preview

PDF - Published Version Download (292kB) | Preview

Abstract

Durian merupakan tanaman buah asli Indonesia yang memiliki nilai ekonomi penting dan mempunyai keanekaragaman tinggi. Analisis keanekaragaman genetik perlu dilakukan untuk mengungkap kekayaan aksesi durian di Indonesia. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi keanekaragaman alel aksesi durian lokal berdasarkan penanda mikrosatelit. Sebanyak 41 aksesi durian lokal koleksi Hortimart Agrocenter Bawen di Jawa Tengah telah dianalisis. Isolasi DNA menggunakan modifikasi metode Vanijajiva. Amplifikasi DNA menggunakan Thermal cycler (peqSTAR 2X) pada tiga lokus mikrosatelit spesifik (mDz78B2, mDz03H9, mDz3D11). Hasil amplifikasi DNA dielektroforesis pada Polyacrilamid Gel Electrophoresis (PAGE) 6%. Visualisasi DNA mikrosatelit menggunakan pewarnaan perak nitrat. Keanekaragaman alel dianalisis dengan metode Unweighted Pair-Group With Arithme Average (UPGMA) menggunakan perangkat lunak NTSys versi 2,02. Hasil penelitian pada ketiga lokus mikrosatelit menunjukkan 92 alel dengan rata – rata alel per lokus adalah 30,6. Jumlah alel tertinggi ditemukan pada lokus mDz3D11sebanyak 41 alel. Frekuensi alel berturut-turut pada lokus mDz3D11 adalah 1,2-12,2 %, mDz03H9 sebesar 1,2- 13,4% dan mDz78B2 adalah 1,2-12,2%. Keanekaragaman durian lokal menggunakan penanda mikrosatelit menunjukkan hasil yang tinggi serta dapat mendeteksi alel spesifik. Berdasarkan analisis keanekaragaman alel mikrosatelit menunjukkan bahwa individu durian bersifat poliploid.

Actions (login required)

View Item